Ошибка апача: [warn] _default_ VirtualHost overlap on port 443, the first has precedence

Такая ошибка вылазит при перезагрузке или переконфигурировании апача.

Причина такой ошибки очень простая - в конфиге апача (httpd.conf, apache2.conf - смотря какой линукс у вас) не хватает строчки:

NameVirtualHost *:443

Добавьте - и будет вам счастье :)